家禽流行性感冒(AI)感染的宿主範圍很廣泛,對每一種禽類都有不同程度的感受性。為執行台灣地區高病原性家禽流行性感冒監控工作,自1998年以來,逐年進行台灣各種禽類AI病毒學監測,監測之種類包括野鳥、家鴨、雞及各種輸入台灣之鳥類等。結果在連續五年10,945個野生水禽樣本數中分離到232株病毒(分離率2.1﹪),金門輸入台灣鳥類2,270樣本數中分離到病毒3株(0.13﹪),包括八哥、相思鳥及畫眉鳥,由國際機場輸入鳥類檢測AI監測之結果,在1,058樣本數中分離5株AIV(0.47﹪),1999年10月起鴨場及活禽市場家鴨監測5,654個樣本數中分離79株病毒(1.4﹪),我們並由2001年以來的140件雞隻送檢病例中分離到10株H6N1病毒株(7.14﹪)。以HI、NI法配合PCR檢測分析各毒株亞型分布,除了由雞隻發現的皆為H6N1外,由金門及國外輸入台灣的飼鳥中以H3N8為主,其他扮演帶毒角色的鴨群則帶有豐富多樣的不同亞型,家鴨以H3N8、H4N6、H5N2及H7N7為主,而遷徙的野鴨則帶有多達20種不同HN組合病毒株,展現帶毒毒株亞型的多樣性,以上毒株皆為弱毒株,沒有高毒力株發現。